全外显子测序分析流程2 - BWA-MEM比对到参考基因组与BAM统计 1. 封装流程特点 python封装, 参数控制 配置文件设置核心参数,便于全流程控制 2. 运行示例 # -s: 样本名称 # -d: 样本结果目录 # -c: 芯片编号 # -t: 线程数, 默认6线程 python alignment.py -s sample -d /path/sample -c chip_id -t threads 3. BWA-MEM比对与BAM统计主程序 # alignment.py import os import optparse i